Proteomika e biobankave dhe AI: nga proteinat te parashikimi i rrezikut

New and Comprehensive Protein Dataset Elevates Health Research

Technology Networks · 2023-10-04 · Burimi

Në intervistën në anglisht të Technology Networks, të publikuar më 4 tetor 2023, Chris Whelan diskuton grupin e të dhënave proteinike të UK Biobank dhe mundësitë kërkimore. Videoja është para studimeve të modeleve të rrezikut të viteve 2024 dhe 2025 të trajtuara këtu dhe nuk vërteton rezultatet ose përfitimin e tyre klinik.

Çfarë është një profil proteinik?

Proteomika mat shumë proteina së bashku. Një profil proteinik është kombinimi i matjeve që përdor modeli për parashikim. Studimet e UK Biobank i lidhin këto matje me diagnozat e regjistruara gjatë ndjekjes. Kontributi i një proteine në parashikim nuk provon vetvetiu se ajo shkakton sëmundjen.

Çfarë tregoi studimi i vitit 2024?

Carrasco-Zanini dhe kolegët analizuan rreth 3000 proteina plazmatike së bashku me të dhënat klinike te 41 931 pjesëmarrës, duke modeluar shfaqjen e 218 sëmundjeve brenda 10 vjetësh. Panelet me 5–20 proteina e përmirësuan parashikimin për 67 sëmundje krahasuar me modelet me të dhëna klinike bazë. Ky është një krahasim kërkimor i caktuar, jo provë se testet diagnostike klinike për 67 sëmundje janë gati.

A është rrjeti nervor gjithmonë më i mirë?

Studimi i vitit 2025 nga Smith dhe kolegët krahasoi modelet lineare ElasticNet dhe rrjetet nervore për 27 rezultate te 53 030 pjesëmarrës të UK Biobank gjatë periudhave të ndjekjes 5- dhe 15-vjeçare. Rrjetet nervore dolën më mirë se modelet lineare për 11 rezultate. I njëjti model nuk është më i miri për çdo detyrë; përdorimi i të dhënave të UK Biobank në të dy studimet nuk i bën ato validime të njëra-tjetrës në popullata të pavarura.

A është renditja e rrezikut e njëjtë me probabilitetin individual?

Indeksi C vlerëson sa mirë modeli i rendit njerëzit sipas kohës së ngjarjes dhe rrezikut; nuk është përqindja e probabilitetit të sëmundjes për një person. Përsëritja e jashtme në studimin e vitit 2024 përfshiu gjashtë sëmundje në EPIC-Norfolk, jo të gjitha modelet. Kalimi në një popullatë tjetër kërkon testimin e renditjes dhe të përputhjes mes probabiliteteve të parashikuara dhe rezultateve të vëzhguara.

Çfarë nevojitet ende para përdorimit klinik?

Këto studime vëzhguese modelimi nuk japin vetvetiu autorizim rregullator ose provë se përdorimi i modelit përmirëson rezultatet për pacientët. Vlerësimi ynë editorial: matjet laboratorike lokale, grupmoshat dhe popullatat e ndryshme, alarmet e rreme, ngarkesa e ndjekjes dhe rruga klinike pas një rezultati me rrezik të lartë duhen vlerësuar së bashku. Artikulli nuk jep këshilla individuale depistimi ose trajtimi dhe nuk pretendon efektivitet për produktet RAI.